A1. Introduzione al Corso: organismi unicellulari e pluricellulari, vantaggi della pluricellularità
A2. Legami chimici in biologia: Elettronegatività e legami chimici covalenti, ionici, di idrogeno, di van der Waals, interazioni idrofobiche.
Diapositive sui legami chimici nelle molecole biologiche.
Macromolecole Biologiche. (1) Proteine: Introduzione. Esempi di Funzioni svolte dalle proteine.
Non covalent bonds
The Chemical Components
of a Cell
Hydrogen bonds
Van der Waals
bond
Hydrophobic effect
Surface tension
The Chemistry of Water
B1. Introduzione al Corso: organismi unicellulari e pluricellulari, vantaggi della pluricellularità
B2. Legami chimici in biologia: Elettronegatività e legami chimici covalenti, ionici, di idrogeno, di van der Waals, interazioni idrofobiche.
Diapositive sui legami chimici nelle molecole biologiche.
Macromolecole Biologiche. (1) Proteine: Introduzione. Esempi di Funzioni svolte dalle proteine.
A3. Dogma centrale della Biologia ed eccezioni alla regola.
Proteine, segue: Unità costitutive: aminoacidi e stereoisomeri L- e D-. Tipi di aminoacidi, legami peptidici. Struttura primaria (condizionata dalla sequenza di basi del gene che codifica per la proteina). Struttura secondaria (alfa-elica e foglietto beta; ottenuti mediante legami di idrogeno fra atomi dei legami peptidici vicini; questi legami diminuiscono la polarità dei legami peptidici). Struttura terziaria, influenzata da legami non-covalenti e covalenti (ponti S-S) fra i gruppi laterali; struttura quaternaria di alcune proteine.
Amino acids and Primary structure of proteins
Seminario [NON SARANNO' CHIESTI ESAME DETTAGLI; TUTTAVIA BISOGNA RICORDARE IL RUOLO DEI CARBOIDRATI LEGATI ALLE PROTEINE DELLA MEMBRANA PLASMATICA]: Glicoproteine: Carboidrati di membrana: siti di riconoscimento Gruppi sanguigni. Glicosaminoglicani,
Sugars Provide an Energy Source for Cells and Are the Subunits of Polysaccharides
Carbohydrates (un altro sito con cenno agli stereoisomeri)
Structural Biochemistry/Carbohydrates
Carbohydrates Can Be Attached to Proteins to Form Glycoproteins
Proteine, segue: Unità costitutive: aminoacidi e stereoisomeri L- e D-. Tipi di aminoacidi, legami peptidici. Struttura primaria (condizionata dalla sequenza di basi del gene che codifica per la proteina). Struttura secondaria (alfa-elica e foglietto beta; ottenuti mediante legami di idrogeno fra atomi dei legami peptidici vicini; questi legami diminuiscono la polarità dei legami peptidici). Struttura terziaria, influenzata da legami non-covalenti e covalenti (ponti S-S) fra i gruppi laterali; struttura quaternaria di alcune proteine.
Seminario [NON SARANNO' CHIESTI ESAME DETTAGLI; TUTTAVIA BISOGNA RICORDARE IL RUOLO DEI CARBOIDRATI LEGATI ALLE PROTEINE DELLA MEMBRANA PLASMATICA]: Glicoproteine: Carboidrati di membrana: siti di riconoscimento Gruppi sanguigni. Glicosaminoglicani,
Diapositive sui ponti di idrogeno fra nucleotidi.
(2) Acidi nucleici: DNA.
Coppie di basi complementari nella doppia elica del DNA. Orientamento
anti-parallelo dei filamenti del DNA. Solchi. Seminario:
sintesi del DNA: Duplicazione/replicazione semi-conservativa del DNA.
(3) Introduzione al RNA: struttura. Seminario: sintesi del RNA (trascrizione del DNA).
L'RNA messaggero, mRNA: Maturazione del mRNA: aggiunta di testa 5', coda 3', splicing alternativo, introni ed esoni.
Structural Biochemistry/Nucleic Acid/DNA/DNA structure
A6. RNA, segue: RNA ribosomiali, rRNA; ribosomi nei procarioti e negli eucarioti. Un rRNA agisce come ribozima (molecola di RNA dotata di attività catalitica). RNA transfer, tRNA (codoni negli mRNA, anticodoni negli tRNA); appaiamento codone-anticodone nel processo di traduzione.
Seminario: Codice genetico: ruolo degli appaiamenti non convenzionali (non canonici) fra anticodone del tRNA e il codone del mRNA.
Diapositive sul codice genetico
Lipidi: introduzione. Trigliceridi (forme accumulo)
You Tube: mRNA splicing
Overview of RNA processing in eukaryotes using ß-globin gene as an example (vedi filmato)
The Royal Swedish Academy of Sciences has decided to award the Nobel Prize in Chemistry for 2009 jointly to
Venkatraman Ramakrishnan
MRC Laboratory of Molecular Biology, Cambridge, United Kingdom
Thomas A. Steitz
Yale University, New Haven, CT, USA
Ada E. Yonath
Weizmann Institute of Science, Rehovot, Israel
"for studies of the structure and function of the ribosome" : The ribosome translates the DNA code into life
The Nobel Prize in Chemistry for 2009 awards studies of one of life's core processes: the ribosome's translation of DNA information into life. Ribosomes produce proteins, which in turn control the chemistry in all living organisms. As ribosomes are crucial to life, they are also a major target for new antibiotics.
Diapositive sui ponti di idrogeno fra nucleotidi.
(2) Acidi nucleici: DNA.
Coppie di basi complementari nella doppia elica del DNA. Orientamento
anti-parallelo dei filamenti del DNA. Solchi. Seminario:
sintesi del DNA: Duplicazione/replicazione semi-conservativa del DNA.
(3) Introduzione al RNA: struttura. Seminario: sintesi del RNA (trascrizione del DNA).
L'RNA messaggero, mRNA: Maturazione del mRNA: aggiunta di testa 5', coda 3', splicing alternativo, introni ed esoni.
A7. Lipidi segue: Fosfolipidi e glicolipidi; molecole anfipatiche ("testa" polare/idroflica e "code" apolari/idrofobiche). Importanza della lunghezza e grado di insaturazione della catena alifatica per uno stato liquido. Micelle, liposomi, doppi strati. Colesterolo.
SEMINARIO: Sfingolipidi. (non argomento di esame).
Membrane biologiche: Funzioni principali delle membrane. Influenza del grado di insaturazione dei fosfolipidi e della quantità di colesterolo sulla fluidità. Introduzione al concetto di libertà di movimento dei fosfolipidi nell'ambito dei singoli foglietti e conseguente libertà di movimento delle proteine nella membrana. Modello mosaico fluido: importanza della fluidità della componente lipidica nel permettere il cambiamento conformazionale e la diffusione laterale delle proteine. Assimmetria dei lipidi di membrana.
A8. Membrane biologiche, segue: Proteine integrali/intrinseche e periferiche/estrinseche di membrana. Funzioni delle proteine di membrana.
Diapositive struttura delle membrane
Trasporto di membrana: Permeabilità del doppio strato lipidico; Osmosi. Gradiente elettrochimico. Trasporto passivo: trasporto facilitato mediato da trasportatori ("carriers") e proteine canale. Trasporto attivo (energia fornita dall'idrolisi dell'ATP, oppure dal trasporto accoppiato). Confronto tra composizione ionica fuori e dentro le cellule con speciale attenzione al Na+, K+ e Ca2+). Ruoli della Na+,K+-ATPasi.
Transport of Small Molecules
B.7. Membrane biologiche (Prof.ssa Valeria Merico)
Diapositive struttura delle membrane (Freitas)
B.8. Trasporto di membrana (Prof.ssa Valeria Merico)
Diapositive trasporto di membrana (Freitas)
A9, B9: Citosol, Ribosomi, Traduzione (Prof. Silvia Garagna)
A10, B10: Reticolo endoplasmatico ruvido e liscio (Prof. Maurizio Zuccotti)
Diapositive sul reticolo endoplasmatico liscio (struttura, funzione; reticolo sarcoplasmatico)
A11, B11: Apparato di Golgi: struttura e funzione). Lisosomi (Dott.ssa Paola Rebuzzini)
Come saprete, seri problemi familiari mi hanno impedito di tenervi le lezioni nelle ultime settimane. Sono estremamente grata ai colleghi del Dipartimento di Biologia e Biotecnologie, Prof.s Cella, Garagna, Merico e Zuccotti e alla dott.ssa Rebuzzini che hanno fatto lezione al posto mio.
Da Giovedi 10 potrò riprendere le lezioni, utilizzando anche gli orari di Biologia della Cellula Vegetale.
Diapositive su endocitosi ed esocitosi
Per vedere filmato illustrato lezione: "The secretory pathway of protein synthesis and sorting": view movie
Endocytosis
Introduction
to endocytosis and exocytosis
How Viruses Hijack Endocytic Machinery
Animazioni su endocytosis and exocytosis
Glycolysis
Glycolysis in animation
Glycolysis, Krebs Cycle, and other Energy-Releasing Pathways
Animation: How glycolysis works
Fermentazione: Riossidazione del NADH formato nella glicolisi in situazioni di anaerobiosi con ripristino delle scorte di NAD che permettono alla glicolisi di proseguire e quindi di formare energia in assenza di Ossigeno.
ASSOCIAZIONE ITALIANA PER LO STUDIO DEL FEGATO
Evitare le malattie epatiche (vedere in particolare "Occhio a ciò che bevi")
Diapositive su endocitosi ed esocitosi
Per vedere filmato illustrato lezione: "The secretory pathway of protein synthesis and sorting": view movie
Mitocondri: diapositive della 1a parte
Catena di trasporto degli elettroni, sintesi dell'ATP, trasportatori presenti sulla membrana mitocondriale interna (importanza del trasporto attivo secondario).
Mitocondri: diapositive della 1a parte
Catena di trasporto degli elettroni, sintesi dell'ATP, trasportatori presenti sulla membrana mitocondriale interna (importanza del trasporto attivo secondario).
B15. Perossisomi: struttura, funzione, processi di ossidazione e produzione di perossido di idrogeno, la catalasi e la detossificazione del perossido di idrogeno (acqua ossigenata).
B16. Microfilamenti: actina, polimerizzazione e ruolo dell'ATP, polarità; tipi di proteine associate all'actina; proteina motore miosina; fasci stretti o lassi, reti tridimensionali (gel). Microvilli, Proteine motore (famiglia delle miosine), contrazione del muscolo striato scheletrico: sarcomero, ruolo dell'ATP e del calcio nelola contrazione. Importanza delle proteine tropomiosina e miosina.
Organization of accessory proteins in a sarcomere
Con i migliori auguri a tutti voi e famiglie
Seminari interessanti svolti l'anno scorso
- Reticolo endoplasmatico: la risposta alle proteine male ripiegate ("Unfolded Protein Response", UPR).
- Dott. Davide Sassera: Simbiogenesi
B17. Microtubuli. Tubuline, polimerizzazione mediata da GTP, instabilità dinamica, centrosoma con coppia di centrioli, ruolo di microtubuli citoplasmatici e dei microtubuli dell'assonema di cilia e flagelli, proteine motore associate ai microtubuli - chinesine e dineine. Centrosoma e Microtubule Organizing Center (MTOC), centrioli/corpi basali. Struttura di cilia e flagelli, assonema. Fuso mitotico. Farmaci attivi sui microtubuli.
Microtubule-associated protein
Microtubule Dynamics and Associated Proteins
Microtubule Motors and Movements
Cilia-Nature's Exquisite Nanomachines
B18. Filamenti intermedi. Modelli di polimerizzazione, classi ed espressione in tipi diversi di tessuti, vantaggio dello sfalsamento delle subunità nella polimerizzazione, utilità in patologia clinica (per la tipizzazione dei tumori).
A18. Nucleo: Involucro nucleare, lamina nucleare, sistema dei pori, organizzazione del DNA con proteine, istoni, cromatina (nucleosomi, eucromatina, eterocromatina), nucleolo.
Diapositive SEMINARIO su trasporto attraverso i pori nucleari
B19. Nucleo: Involucro nucleare, lamina nucleare, sistema dei pori, organizzazione del DNA con proteine, istoni, cromatina (nucleosomi, eucromatina, eterocromatina), nucleolo.
Diapositive SEMINARIO su trasporto attraverso i pori nucleari
Nucleoide nei Procarioti (per vostra informazione)
Diapositive sul ciclo cellulare
Meiosi: importanza nella riproduzione sessuata. Cromatidi, cromosomi omologhi, Stadi della meiosi: meiosi I e meiosi II, appaiamento cromosomi omologhi, complesso sinaptonemale, crossing over, ricombinazione genica nella Profasi I (leptotene, zigotene, pachitene, diplotene, diacinesi). Paragone fra meiosi e mitosi.
Diapositve seminario formazione dei gameti maschili e femminile e sulla fecondazione
Cell Division, Mitosis, and Meiosis
Homologous
recombination
Cell
division, mitosis and meiosis
Meiosis (altro sito)
Meiosis tutorial [vedi animations]
I vantaggi della riproduzione sessuata
Recombination between Homologous DNA Sites (concetti di Genetica)
Meiosis, Genetic Recombination, and Sexual Reproduction
Tying up Loose Ends: Generation and Repair of DNA Double-Strand Breaks
Filmati:
Mitosis
Cell
Cycle
Spero di essere riuscita a rendervelo interessante e possibilmente affascinante!
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